I microrganismi svolgono un ruolo importante nell'influenzare le sementi, di cui i funghi sono il gruppo più numeroso. Questi patogeni sono disastrosi perché riducono la qualità dei semi, la germinazione e il vigore delle piantine, riducendo la popolazione ottimale di piante nel campo. Un'indagine condotta nella regione di Konkan ha rivelato che la varietà di riso Ratnagiri-2 ha mostrato la massima decolorazione dei semi (18%), mentre la decolorazione minima dei semi (3%) è stata registrata in Ratnagiri-24, Karjat-4 e Sahyadri-3. Nel blotter test, l'associazione tra i funghi portatori di semi e la germinazione di diverse varietà di riso ha rivelato che Karjat-4 e Panvel-3 hanno registrato l'associazione rispettivamente del 20% e del 35,50%. Per quanto riguarda la germinazione, la varietà Karjat-4 ha registrato il 98,50% di germinazione, mentre la varietà Panvel-3 ha registrato il 60% di germinazione dei semi con una perdita massima del 40%. Con il metodo della piastra Agar, Ratnagiri-1 e Ratnagiri-73 hanno mostrato la massima presenza di funghi portatori di semi (25%) e (27%) rispettivamente. Nove specie fungine: Fusarium moniliforme, Fusarium semitectum, Fusarium fusarioides, Curvularia lunata, Curvularia pallescens, Aspergillus niger, Trichoderma harzianum, Rhizopous stolonifer.