Come tutti i ciliati, P. tetraurelia riarrangia il proprio genoma a ogni generazione sessuale durante lo sviluppo del macronucleo somatico dal micronucleo germinale. I riarrangiamenti comprendono l'escissione precisa di brevi sequenze derivate da trasposoni, chiamate IES (Internal Eliminated Sequences). La fedeltà di escissione è essenziale per la metà dei geni del paramecio che contengono almeno una IES. L'escissione di una frazione di esse dipende da piccoli RNA materni legati a proteine Piwi (chiamati scnRNA) che vengono prodotti dall'intero genoma germinale durante la meiosi. Questo meccanismo pone un problema nella coniugazione tra due ceppi con polimorfismi inserzionali: una cellula teoricamente non sarà in grado di escindere un SEI portato dall'allele paterno ricevuto se questo SEI è assente dall'allele materno o se la sequenza è troppo divergente. Questa tesi dimostra che i polimorfismi non generano difetti di escissione materna. Tuttavia, un meccanismo sconosciuto sembra causare problemi di escissione per i SEI emizigoti e può contribuire all'isolamento riproduttivo.