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Tra gli animali da allevamento in India, i bovini e i bufali sono molto importanti e contribuiscono notevolmente all'industria zootecnica e, di conseguenza, all'economia del Paese. In tutto il Paese sono in corso vari programmi di miglioramento genomico per migliorare le razze bovine e bufaline. Il sequenziamento del genoma di entrambe le specie è quasi completo. Sebbene il genoma dei bovini sia ben completato, quello dei bufali è solo abbozzato e con una copertura molto ridotta. Dal genoma incompiuto del bufalo, è assolutamente necessario scoprire i geni importanti per l'agricoltura. Ciò è possibile solo annotando il suo genoma mediante un'analisi comparativa con il genoma ben rifinito della mucca, un membro della sua stessa famiglia. Al giorno d'oggi, i browser genomici sono molto popolari nel campo dell'annotazione del genoma, in quanto facilitano la visualizzazione grafica degli elementi genomici sul genoma e il confronto del genoma di due o più organismi.
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