O contexto físico da sub-bacia média do rio Ayuquila apresenta uma grande variedade de gradientes estruturais, litológicos, edafológicos e altitudinais - resultando em diferentes tipos de climas, vegetação e fauna - o que explica o regime hidrológico que rege a bacia. A área de estudo abrange dez municípios: Autlán de Navarro, Ejutla, El Grullo, El Limón, San Gabriel, Tolimán, Tonaya, Tuxcacuesco, Unión de Tula e Zapotitlán de Vadillo, que constituem a Junta Intermunicipal de Meio Ambiente para a Gestão Integral da Cuenca Baja del Río Ayuquila (JIRA), um Organismo Público Descentralizado. O objetivo deste trabalho foi realizar uma análise territorial do contexto físico desta sub-bacia para ajudar a compreender a ação comunitária que reuniu os municípios com o objetivo de resgatar este rio do elevado nível de contaminação que apresentava.