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A fim de obter produtos probióticos funcionais e seguros para consumo humano, é crucial um controlo de qualidade rápido e fiável destes produtos. Atualmente, a análise da maioria dos probióticos ainda se baseia em métodos dependentes de culturas, o que torna esta abordagem insensível, laboriosa e morosa. Neste estudo, 10 produtos comerciais foram submetidos a uma análise microbiana utilizando uma abordagem independente da cultura e os resultados foram comparados com os resultados de uma análise convencional dependente da cultura. A abordagem independente da cultura envolveu a extração direta de ADN, a amplificação por PCR da região V3 do ADN ribossómico 16S e a separação dos amplicões num gel de gradiente desnaturante. A captura digital e o processamento dos padrões de bandas DGGE permitiram a identificação direta dos amplicões ao nível da espécie. Em comparação com a análise dependente da cultura, verificou-se que a abordagem DGGE DGGE tem uma sensibilidade muito mais elevada para a deteção de estirpes microbianas em produtos probióticos de forma rápida, fiável e reprodutível. Em seguida, a IgG isolada, o soro de leite e os probióticos isolados são misturados numa proporção de 1:5:1.