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Les fibres alimentaires et les médicaments humains - antibiotiques et non antibiotiques - peuvent moduler la flore intestinale en favorisant la croissance des archées du côlon et l'endosymbiose, ce qui entraîne un changement climatique, l'évolution des superbactéries et des virus émergents et la création du phénotype de la maladie. Un régime riche en fibres est digéré par la flore intestinale, ce qui entraîne la production d'acides gras à chaîne courte et inhibe la croissance endosymbiotique et archaïque du côlon. Ainsi, un régime pauvre en fibres modifie le microbiome intestinal dans le côlon et favorise la croissance des archées. Les archées développent un mécanisme protecteur de résistance aux antibiotiques et dominent la microflore colique. Par sélection naturelle et échanges d'ADN/gènes avec d'autres organismes coliques et endosymbiotiques, les archées coliques transfèrent les gènes de résistance aux antibiotiques à la flore colique. Cela constitue la base de la génération de superbactéries résistantes à tous les antibiotiques. L'archée colique génère également des viroïdes ARN qui sont convertis en viroïdes ADN par la transcriptase inverse HERV de l'épithélium colique et s'intègrent au génome colique. Les viroïdes à ARN et à ADN s'hybrident avec la population viroïde et bactérienne du microbiome intestinal et avec l'ADN et l'ARN du virobiome intestinal, ce qui conduit à l'émergence de virus.