Flavanone haben das Gerüst einer 2-Phenyl-Benzopyran-4-on-Struktur. Sie sind Isomere von Chalkonen, die aus letzteren durch die Wirkung von Chalkon-Isomerasen in vivo gebildet werden. Die Stereochemie an C-3 ist bei allen natürlich vorkommenden Flavanonen die (3s)-Konfiguration. Die wichtigsten Zwischenprodukte bei der Synthese aller Flavonoide sind die Chalkonen/Flavanon-Isomere. Das gemeinsame Vorkommen vieler Flavonoid-Verbindungen in Pflanzen weist auf ihre enge biogenetische Verwandtschaft hin. Flavanone treten gelegentlich gemeinsam mit Chalkonen auf, da sie Isomere sind und leicht ineinander überführt werden können.