Le secteur des transports est l''un des secteurs les plus impliqués dans les problèmes environnementaux. Pour que ce secteur se développe dans un contexte de durabilité économique et environnementale, la Commission Européenne a préconisé dans plusieurs documents d''appliquer la tarification au coût marginal social. Ce système de tarification consiste à faire payer les usagers la totalité des coûts internes (coûts d''exploitation) et externes (coûts environnementaux, coûts de congestion et coûts des accidents). Pour l''activité portuaire, qui est également concernée par ce système de tarification, la théorie économique n''offre pas tous les outils nécessaires à l''estimation du coût marginal social. Ce travail de recherche propose de pallier cette lacune théorique. Nous avons ainsi proposé des modèles permettant de déterminer le coût marginal d''exploitation des services portuaires ainsi que les coûts marginaux externes des accidents, de la pollution atmosphérique et sonore, et de la congestion dans les ports. Certains modèles ont été testés empiriquement pour le port de Saint-Brieuc en France.