I batteri racchiusi all'interno del biofilm sono estremamente resistenti ai trattamenti antibiotici; tale resistenza può essere spiegata con ipotesi, non necessariamente limitate alle seguenti. In primo luogo, il batterio bybiofilm secreto dall'EPS, agisce come barriera fisico-chimica, impedendo così la penetrazione di anticorpi o di molti antibiotici. L'EPS ha una carica negativa e funziona come una resina a scambio ionico che è in grado di legare un gran numero di molecole di antibiotici che stanno tentando di raggiungere le biopellicole incorporate. In secondo luogo, i batteri del biofilm incorporato non sono generalmente impegnati attivamente nella divisione cellulare, sono di dimensioni più piccole e meno permeabili agli antibiotici. Dimostriamo qui per la prima volta che le colture di biofilm di aMycobacterium sono in grado di crescere a concentrazioni di farmaci più elevate (cioè hanno una MIC più elevata) rispetto alle colture a sospensione. La MIC di una concentrazione di farmaci selezionati che inibiscono la crescita esponenziale del biofilm è risultata essere superiore alla MIC delle colture planctoniche.
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