La PDT est sélective ; elle peut cibler des tissus spécifiques sans causer de dommages importants aux tissus sains environnants. Toutefois, son efficacité peut varier en fonction du type et de la localisation de l'affection traitée. En outre, la lumière utilisée pour l'activation a des limites en termes de pénétration des tissus, ce qui peut affecter son applicabilité dans certaines situations. Il est important de noter que le choix du traitement dépend du diagnostic spécifique et des caractéristiques de l'état du patient.