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O presente texto visa apresentar a transcriptômica vegetal a alunos da área de Ciências Biológicas e afins. Tal tema visa entender como as plantas regulam a expressão de seus genes perante condições específicas (sejam desenvolvimentais ou de estresse), empregando ferramentas de Biologia Molecular e Bioinformática. A comparação de populações de transcritos (transcriptomas) nos permite, resumidamente: (1) compreensão e descoberta de mecanismos/processos fisiológicos atuantes nas condições analisadas; e (2) identificação de genes intimamente associados a processos de importância, sejam relativos a resistência a doenças ou tolerância a estresses abióticos. No primeiro caso, tem-se o potencial de decifrar molecularmente os organismos e suas capacidades. No segundo, tal prospecção pode representar uma nova fonte de recursos genéticos, buscando-se genes de interesse em espécies aparentadas (e ainda pouco estudas) de culturas importantes, as quais podem ser melhoradas geneticamente via transgenia. Tais ações representam grandes desafios da Ciência Moderna.