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Les eaux usées sont susceptibles de renfermer et véhiculer une grande variété d'un polluant organique et d'agent pathogène pour l'homme. Les organismes pathogènes présents dans les eaux usées d'une collectivité en reflètent l'état sanitaire. Le traitement de l'eau usée a pour but principale d'éliminer ou détruire ces polluants et ces micro-organismes. Alors l'objectif principale de ce travail et de faire évaluer la qualité de traitement physico-chimique et microbiologiques de la STEP d'Oujda et principalement la performance épuratoire des bassins anaérobies, et cela en effectuent les analyses physico-chimiques et de dénombrement des indicateurs de contamination fécale des eaux usées de la STEP en sept (7) point de prélèvement: entrée de la STEP, sortie des bassins anaérobies, sortie des bassins aérobies ( 1ère étage et 2ème étage ) de 1ère tranche et de 2ème tranche (Extension) et à la sortie de la STEP. Les résultats obtenus après traitement montre une diminution de la DBO, DCO et MES, au niveau de la STEP, et que ces valeurs sont dans les normes. Le rendement d'épuration des bassins anaérobies est de 49% pour MES, et 30% pour DCO et DBO5.