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Le crocodile joue un rôle clé dans le maintien du système écologique dans le monde entier. Ils ne sont pas seulement utiles pour contrôler la population des rongeurs mais aussi pour les humains en arrêtant la propagation des maladies. Ils contribuent également à prévenir la cécité des rivières. Les crocodiles juvéniles mangent les escargots dans lesquels les parasites sont responsables d'une partie de leur cycle de vie. Les crocodiles sont des éléments importants de la chaîne alimentaire d'un écosystème. L'éradication d'une espèce de son écosystème modifie considérablement la structure de la population des autres créatures. Les crocodiles, en tant que prédateurs supérieurs, sont connus comme des espèces élémentaires ; bien qu'ils contribuent en outre à la chaîne alimentaire en tant que proies alors qu'ils sont encore jeunes. Les espèces crocodiliennes peuvent également jouer un rôle anthropique utile dans l'environnement. Dans certaines régions, les crocodiles sont utiles pour contrôler le nombre de parasites agricoles graves en consommant les rongeurs et les insectes nuisibles. De nos jours, les crocodiles sont élevés en captivité dans le monde entier à des fins commerciales. La conservation du crocodile des marais au Pakistan par le biais d'une utilisation durable est considérée comme la stratégie qui pourrait sauver la seule espèce existante de l'ordre des Crocodylia à long terme.