Le biofilm est une communauté microbienne sessile sur une surface vivante ou inerte. Dans les fermes d'exploitation laitière, les biofilms se forment inévitablement sur les surfaces du matériel humides. Il existe en deux types, le biofilm positif constitué de flores d'intérêt technologique comme les bactéries lactiques qui jouent un rôle important en empêchant l'adhésion des microorganismes pathogènes et le biofilm négatif qui se compose de flores d'altération et de flores pathogènes. Le biofilm négatif peut se détacher de l'équipement et contaminer le lait cru en provoquant l'altération de sa qualité organoleptique et peut être à l'origine de maladies graves.
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