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Este trabalho teve como objetivo a caraterização dos componentes bioactivos de fungos endofíticos isolados da casca do caule da planta Sclerocarya birrea utilizando FT-IR, RMN e EI-MS e, com base na atividade antimicrobiana, estes dois fungos endofíticos (Fusarium oxysporum e Penicillium sp) foram seleccionados e fermentados para produção em grande escala em caldo de dextrose de batata e em meio sólido de arroz, respetivamente. O seu extrato bruto de acetato de etilo foi fraccionado e purificado por cromatografia em coluna de gel de sílica. A partir da análise espetral, a fração SB7-FO-F10 foi caracterizada como 1-Hexil-6-(-3-metoxi)-hex-2-enoato.