Le coronavirus est apparu en décembre 2019 en Chine. Il est considéré très contagieux et très transmissible à de nombreuses personnes très rapidement dans la plupart des pays et se propage à plus grande échelle dans les continents pour créer une pandémie de SARS-CoV-2.Pendant la durée médiane d'incubation (5 à 14 jours), la personne est considérée contagieuse. Les symptômes principaux de ce virus sont la fièvre, les difficultés respiratoires de type toux ou essoufflement. D'autres symptômes peuvent également être présents comme l'asthénie l'anorexie, des courbatures, une dyspnée. En premier lieu, le diagnostic se fait par l'examen clinique confirmé par des examens. Soit un test rapide basé sur la détection des antigènes viraux ou sur la détection des anticorps de la cellule hôtes. Ces derniers peuvent engendrer des faux résultats. Un test RT-PCR ou un scanner thoracique peuvent aussi permettre de savoir ou de confirmer la COVID 19.La souche mère de Wuhan subit des mutations variantes. Pour la détection de ces variants on a eu recourt à la méthode de séquençage Sanger.