Une étude comparative de la communauté microbienne
Des sols non perturbés et récupérés dans le sud-est du Kansas
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Le but de ce projet est de comparer les communautés microbiennes du sol récupéré il y a 33 ans à Monahan avec le sol original à O'Malley. Les données recueillies dans le cadre de ce projet visent à déterminer s'il existe une corrélation entre l'âge du sol et la communauté microbienne du sol. L'analyse de l'ADN du sol est un moyen de comparer les communautés microbiennes du sol. L'ADN du sol a été isolé à partir de plusieurs échantillons provenant de deux sites (sols récupérés et sols non perturbés) à l'aide d'un kit d'isolement de l'ADN. En utilisant l'ADN de la communau...
Le but de ce projet est de comparer les communautés microbiennes du sol récupéré il y a 33 ans à Monahan avec le sol original à O'Malley. Les données recueillies dans le cadre de ce projet visent à déterminer s'il existe une corrélation entre l'âge du sol et la communauté microbienne du sol. L'analyse de l'ADN du sol est un moyen de comparer les communautés microbiennes du sol. L'ADN du sol a été isolé à partir de plusieurs échantillons provenant de deux sites (sols récupérés et sols non perturbés) à l'aide d'un kit d'isolement de l'ADN. En utilisant l'ADN de la communauté comme modèle, des fragments d'ADN eubactérien, archéen et fongique ont été amplifiés par PCR en utilisant des amorces spécifiques. Des tentatives ont été faites pour cloner l'amplicon purifié. Une autre approche basée sur les isolats cultivables a également été suivie. Parallèlement à la technique moléculaire indépendante de la culture, les échantillons de sol du site non perturbé ont été traités pour identifier les isolats bactériens sur des milieux de culture. Les isolats obtenus ont été comparés aux isolats bactériens déjà isolés et identifiés sur le site récupéré en utilisant le polymorphisme de la longueur des fragments de restriction. La concentration bactérienne a également été comparée à celle des échantillons de sol récupérés.
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