Las vacunas inactivadas se utilizan principalmente en todo el mundo para prevenir las infecciones por flavivirus. En la actualidad, están aprobadas en Rusia 6 vacunas contra la encefalitis transmitida por garrapatas producidas por inactivación con formalina del virus de la encefalitis transmitida por garrapatas (VET) a partir de fibroblastos de embrión de pollo. No hay vacunas basadas en el tipo siberiano de EVE, que domina en la mayoría de las zonas endémicas de Rusia. La cobertura media de la población de las regiones endémicas de Rusia con la vacunación contra la encefalitis transmitida por garrapatas es de aproximadamente el 5%. La larga duración de la inmunización y la necesidad de revacunación cada 3 años han impulsado la búsqueda de nuevas formas de profilaxis. La inmunización genética de ratones con ADN plasmídico clonado con los genes prM, E y NS1 de la EEV bajo el control de promotores reconocidos por las ARN polimerasas eucariotas proporcionó protección sólo contra una cepa homóloga del virus. Las vacunas de ADN demostraron ser inestables en las células eucariotas y capaces de integrarse en los cromosomas celulares. La introducción del ARN genómico completo del virus, pero no de los genes E y NS1, también dio lugar a una protección contra la infección viral. Las bacterias recombinantes y los péptidos antigénicos múltiples indujeron anticuerpos específicos contra el virus.
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