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La surveillance des micro-organismes bactériens et fongiques associés à Saccharum officinarum (canne à sucre) dans le jardin ethnobotanique de l'Université Wesley, Ondo, a été réalisée par le biais de différents processus microbiens. Ceux-ci impliquent la collecte d'échantillons de plantes de canne à sucre pour isoler les maladies bactériennes et fongiques associées à la canne à sucre et le développement de l'inventaire des maladies associées à la canne à sucre. Des échantillons du sol, de la tige, de la racine et de la feuille ont été cultivés sur de la gélose nutritive, de la gélose dextrose de pomme de terre et de la gélose de comptage de plaque respectivement et les isolats obtenus ont été identifiés en utilisant des caractéristiques culturelles, morphologiques et biochimiques. Les isolats bactériens identifiés à partir des échantillons collectés étaient Aeromonas sp., Bacillus sp., Corynebacerium sp., Pseudomonas sp., Micrococcus sp., Serratia sp., Staphylococcus sp., Enterococcus sp., tandis que les isolats fongiques identifiés étaient Penicillium sp, Aspergillus sp., Mucor sp., Rhizopus sp., Saccharomyces sp. Pendant la période de ce travail de recherche, les échantillons de feuilles et de tiges malades étaient communs tout au long de la période d'étude et étaient à leur maximum pendant la saison des pluies.