L'infection par le virus de l'hépatite B (HBV) constitue en Afrique Subsaharienne un problème de santé publique majeur. Le taux de prévalence de la protéine d'enveloppe du virus, l'antigène HBs (AgHBs) peut atteindre jusqu'à 30% dans certains pays. De plus on estime entre 70 à 100 millions le nombre de porteurs chroniques de l'HBV avec une fréquence de décès annuels de l'ordre de 250 000. Les données concernant l'infection concomitante par le virus de l'hépatite D (HDV) virus satellite de l'HBV, sont très rares car très peu d'études ont été conduites. Les génotypes HBV/E, et l'HBV/A ont été identifiés en Afrique subsaharienne, le génotype D étant cantonné à l'Afrique du Nord. De plus, plusieurs souches recombinantes entre le génotype E et les génotypes, A et D ont aussi été décrit. Concernant l'HDV, 4 génotypes "africains", HDV 5, -6, -7 et -8 ont été caractérisés au laboratoire chez des patients africains immigrés en France, infectés dans leur pays d'origine. Au cours de cette étude nous avons voulu déterminer l'épidémiologie moléculaire des souches HBV et HDV circulant au Niger, et plus généralement dans la région du Sahara (Mali de Mauritanie et du Tchad).
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