Einzelne parodontale Läsionen beherbergen Millionen von genomischen Kopien von humanen Herpesviren, humanen Cytomegaloviren, Epstein-Barr-Viren, humanen Papillomaviren, humanen Immunschwächeviren, Hepatitis B und C Viren. Von ihnen sind EBV und CMV die am häufigsten untersuchten Viren in der Parodontologie und es wurden mehr als 1 Million Genomkopien an einer einzigen Infektionsstelle identifiziert. Es wird angenommen, dass der gingivale Sulkus oder die parodontale Tasche als Reservoir zwischen den Perioden des Wiederauftretens der herpetischen Infektionen dient. Adhärenz ist für die Etablierung von Bakterienpopulationen auf Schleimhautoberflächen erforderlich, ein wichtiger erster Schritt bei der Infektion, und eine erhöhte Anfälligkeit für bakterielle Adhärenz kann die Entstehung von Pathogenen unterstützen. Viren können in diesem Prozess eine wichtige Rolle spielen, indem sie die Zellen für bakterielle Infektionen vorkonditionieren. Möglicherweise ist die Parodontitis das Ergebnis umfangreicher und teilweise gegensätzlicher Immunantworten gegen virale und bakterielle Kombinationsinfektionen.