Die verschiedenen Klassen von Vererbungsmustern von Plasmagenen und Allosomen aus dem Mendelschen autosomalen Vererbungsmuster unterteilen das Genom in eine Fraktion, deren Hauptregel darin besteht, dass die Fitness aller Gene in einem Satz auf die gleiche Weise maximiert wird. Jeder Satz wird ausgewählt, der die Fähigkeit hat, den Phänotyp des Organismus so zu verändern, dass das Gen maximal verbreitet oder vervielfältigt wird. Das gleichzeitige Vorhandensein mehrerer solcher Sets im selben Genom führt zu einem Konflikt, der als intragenomischer Konflikt bekannt ist. Die zytoplasmatische männliche Sterilität (CMS), die bei Pflanzenarten häufig vorkommt, ist auf einen intragenomischen Konflikt zurückzuführen. Die Beziehung zwischen intragenomischem Konflikt und CMS, die Art des Konflikts, der molekulare Mechanismus von CMS und Altruismus werden in diesem Kapitel erörtert.
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