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Il microbiota umano è l'insieme di microorganismi simbiontici che si trovano nel tubo digerente dell’uomo. Negli esseri umani si trovano tra le 500 e 1000 specie differenti di microorganismi, i più numerosi dei quali sono batteri, ma anche in misura inferiore miceti e virus. Tra i batteri la maggioranza è anaerobia, più o meno stretta o facoltativa (molti sopravvivono in assenza di ossigeno e alcuni ne tollerano la presenza). Il batterio intestinale più conosciuto nell'Uomo è l'Escherichia coli. Il microbiota umano si sviluppa nel corso dei primi giorni di vita e sopravvive, salvo in caso di malattie, sorprendentemente a lungo.
Ogni individuo possiede il suo proprio microbiota, i ricercatori dell'INRA hanno messo in evidenza l'esistenza di un piccolo numero di specie condivise da tutti che costituirebbero il nucleo filogenetico del microbiota intestinale umano.Negli ultimi anni gli studi si sono concentrati sul Microbioma, un vero e proprio genoma microbico che vive nel e sul nostro organismo, che supera quantitativamente anche il numero delle cellule umane.
Ogni individuo possiede il suo proprio microbiota, i ricercatori dell'INRA hanno messo in evidenza l'esistenza di un piccolo numero di specie condivise da tutti che costituirebbero il nucleo filogenetico del microbiota intestinale umano.Negli ultimi anni gli studi si sono concentrati sul Microbioma, un vero e proprio genoma microbico che vive nel e sul nostro organismo, che supera quantitativamente anche il numero delle cellule umane.