In einer Lotterie gewinnt Makoto Naegi die Aufnahme in die Hope's Peak Academy einer renommierten Privatschule, die nur die Besten der Besten akzeptiert: Super-Genies, Super-Athleten, Super-Idole bis hin zu Bandenführern und Computernerds. Doch Makotos Glück ist nur von kurzer Dauer, denn schon bald ist er Teil eines mörderischen Spiels. Zusammen mit vierzehn weiteren Studenten wird er von dem sadistischen Teddybären Monokuma gefangen gehalten. Es gibt nur eine einzige grausame Möglichkeit, der Situation zu entkommen: Sie müssen einen ihrer Mitschüler töten!