John Peter McAllister, der einzige Nicht-Japaner, der es jemals zum Ninja-Meister geschafft hat, bricht mit seinem Clan. Auf der Flucht durch die USA sucht er seine verschollene Tochter und hilft gleichzeitig Menschen, die in Not geraten sind. Doch die Schatten seiner Vergangenheit lassen ihn nicht los. Sein ehemaliger Schüler, der gefährliche Attentäter Okasa, ist ihm bereits auf den Fersen ...