Die DATS macht sich für den endgültigen Kampf gegen Merukimon bereit, jedoch stellt sich immer mehr heraus, dass der eigentliche Gegner ein anderer ist. Neben den Auseinandersetzungen in beiden Welten müssen sich Marcus und seine Begleiter auch Spannungen innerhalb des Teams stellen. Marcus und Keenan sehen sich außerdem mit ihrer Vergangenheit konfrontiert. Können unsere Freunde schließlich als geeintes Team ein friedliches Nebeneinander von Digimon und Menschen wiederherstellen?