Nach dem grausamen Massaker an seiner Familie durch den eiskalten Söldner Sub-Zero wird Hanzo Hasashi in das qualvolle Reich der Toten verbannt. Dort erhält er im Gegenzug für seine Versklavung durch den finsteren Quan Chi die Chance, seine Familie zu rächen - und wird als Scorpion, eine verlorene, auf Rache erpichte Seele, wiedererweckt. Zurück im Reich der Lebenden versammelt Lord Raiden ein Team von Elitekriegern - den Shaolin-Mönch Liu Kang, Special Forces Officer Sonya Blade und den Action-Star Johnny Cage - eine untypische Heldengruppe mit nur einer Chance, die Menschheit zu retten. Dazu müssen sie Shang Tsungs Horde von Outworld-Gladiatoren besiegen und das Mortal Kombat-Turnier gewinnen.