Nach langen Jahren des Krieges und der Unruhen ist endlich Frieden in Japan eingekehrt. Kenshin jedoch ist es immer noch nicht gelungen, die Geister der Vergangenheit zu besiegen. Also geht er erneut auf Reisen, obwohl eine unbekannte Krankheit ihn bereits schwächt. Fernab der Heimat versucht er so jene Sünden zu sühnen, die er einst als legendärer Attentäter Battousai beging. Derweil wartet die zurückgebliebene Kaoru sehnsüchtig darauf, dass Kenshin endlich wiederkehrt und erinnert sich dabei an schöne, schmerzhafte und auch gefahrvolle Episoden aus ihrem gemeinsamen Leben. Doch auch Kaoru leidet an derselben geheimnisvollen Krankheit wie ihr Geliebter. Die Zeit läuft beiden davon - um sich ein letztes Mal in den Armen zu liegen und schlussendlich doch noch Erlösung zu finden ... The Chapter of Atonement ist die abschließende OVA zur Rurouni Kenshin Serie. Sie vereint eine packende Story mit perfekter Animation und gilt zu Recht als Meisterwerk - eine der besten OVAs in der Geschichte des Anime.