Yuma und Astral versuchen nach wie vor, die "99 Nummernkarten" zu finden, um Astrals Erinnerung wieder herzustellen. Doch das ist leichter gesagt als getan, denn die beiden kommen nicht wirklich gut miteinander aus. Zu allem Überfluss steht nun auch noch das "World Duel Carnival" an - das bisher größte Duel-Monsters Turnier überhaupt! Dort treffen sie nicht nur auf besonders starke-, sondern auch äußerst gefährliche Gegner. Unheimliche, neue Feinde treten auf den Plan und drohen die Welt erneut ins Chaos zu stürzen!