Etude des interactions entre protéines et lésions de l''ADN par SPRi
A STUDY OF THE INTERACTIONS BETWEEN PROTEINS AND DNA DAMAGE USING SURFACE PLASMON RESONANCE IMAGING (SPRI)
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Les lésions de l'ADN sont un défi pour les systèmes de réparation cellulaire. Parmi ceux-ci le système de réparation par excision de bases (BER) assure la reconnaissance et le retrait de la base lésée. Avec la résonance plasmonique de surface par imagerie (SPRi), nous disposons d'une technique d'analyse en temps réel, sans marquage avec laquelle nous avons pu observer des interactions parallélisées d'une protéine enzymatique purifiée (Fpg, OGG1, EndoIV ou Ape1) vis- à-vis de différentes lésions sur des oligonucléotides de synthèse immobilisés sur une surface d'or. Les domma...
Les lésions de l'ADN sont un défi pour les systèmes de réparation cellulaire. Parmi ceux-ci le système de réparation par excision de bases (BER) assure la reconnaissance et le retrait de la base lésée. Avec la résonance plasmonique de surface par imagerie (SPRi), nous disposons d'une technique d'analyse en temps réel, sans marquage avec laquelle nous avons pu observer des interactions parallélisées d'une protéine enzymatique purifiée (Fpg, OGG1, EndoIV ou Ape1) vis- à-vis de différentes lésions sur des oligonucléotides de synthèse immobilisés sur une surface d'or. Les dommages étudiés sont une base oxydée (8-oxoG), une base cyclisée (cycloadénine) et des analogues de sites abasiques (THF et C3). Nous avons également étudié leur action sur des lésions multiples, associant les bases 8-oxoG et 8-oxoA sur le même brin d'ADN. L'originalité de notre dispositif associe l'analyse directe de l'interaction ADN/protéine et l'approche indirecte de sa conséquence par une stratégie d'hybridation et d'amplification du signal. Les résultats obtenus permettent d'envisager l'étude de la réparation simultanée par des extraits cellulaires ou tissulaires humains.
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