Une profonde modification des politiques publiques de S&T peut être observée à partir des années 1990 dans les pays dites développés. Cette modification reflète principalement un changement de perception du rôle de l'État dans le soutien de la recherche : du renforcement institutionnel vers le soutien préférentiel aux politiques du d'innovation. Cette dernière est désormais perçue comme le but ultime de l'activité scientifique et la figure du " chercheur-entrepreneur " remplace celle de l'" intellectuel engagé ". Le modèle organisationnel de l'Agence, inspirée par la NSF aux États-Unis, s'impose alors au centre des appareils de politiques scientifiques dans les pays du Nord comme dans ceux du Sud. Ce choix semblable est observable bien que les objectifs de ces politiques, entre pays du Nord et ceux du Sud, soient très disparates. Caractérisée par une grande flexibilité d'action et un champs d'action à géométrie variable, les agences de financement de la recherche sont devenues aujourd'hui l'outil central de la mise en oeuvre des politiques publiques de S&T.