Les eaux usées entrainent les risques sanitaires liés à leur réutilisation, si elles ne sont pas préalablement traitées. Ce travail évalue l'impact des eaux usées de la Prison Centrale et de l'Hôpital régional de la ville de Ngaoundéré, Cameroun sur la qualité des végétaux, des sols et des eaux utilisées dans l'agriculture urbaine. Les paramètres physico-chimiques et biologiques des eaux, des sols et des organes de plantes ont été déterminés au laboratoire de l'IUT de Ngaoundéré. Les teneurs en métaux lourds (Fe, Cu, Pb, Cd et Zn) sont élevées dans les sites de la Prison et de l'Hôpital que le témoin, et sont globalement au-dessus des normes internationales. La biodisponibilité de ces métaux est plus élevée dans les plantes et au niveau des sols de la Prison et de l'Hôpital par rapport au sol témoin et s'explique par les apports des eaux usées. Les plantes stockent particulièrement le cadmium au niveau des feuilles et les autres métaux au niveau des racines. Les teneurs en métaux lourds dans les plantes sont les plus élevées chez C. benghalensis et les plus faibles chez A. conyzoïdes. La phytodisponibilité des métaux lourds est liée au pH et de la matière organique des sols.