En el mundo es cada vez mayor el uso de enmiendas, esenciales para producir un cultivo orgánico libre de agroquímicos. Sin embargo muchas veces, la necesidad de obtener un producto diferenciado con gran demanda, induce a no respetar normas que se deberían cumplir en una producción orgánica. Con respecto a la fertilización con abonos o enmiendas orgánicas, es indispensable conocer y saber el origen y etapas de procesado del los mismos. La calidad microbiológica del compostaje estimula la respuesta de la microbiota del suelo mejorando la calidad del cultivo. Por otra parte, la presencia de microorganismos benéficos contribuiría al control de patógenos, que pueden causar perjuicios a la producción y a la salud humana. Los estudios realizados a campo y en laboratorio permitieron establecer la dinámica y el comportamiento de la microflora del suelo durante el ciclo del cultivo y postcosecha.