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L'étude des processus intervenant dans la réalisation d'auto-assemblages moléculaires est au centre de nombreuses recherches en physique, chimie ou biologie. Dans ce cadre les organisations de surface formant des structures mono-couche constituent des systèmes particulièrement attractifs autant pour leur utilisation potentielle, que pour la simplification apparente des processus d'organisation liés à la réduction de la dimensionnalité. Les résultats de microscopie à effet tunnel rapportés dans ce livre permettent d'appréhender les processus régulant l'organisation de ces structures supra-moléculaire à l'interface entre un milieu liquide et des surfaces atomiquement plates de Carbone (graphite HOPG). Cette étude permet de déduire les paramètres nécessaires à la réalisation de structures présentant des pores nanométriques et réguliers à la surface de ces échantillons. Utilisés comme des pièges pour la fixation d'autre molécules présentes en solution, ces pores révèlent des propriétés imprévues de tamisage de surface, permettant et contrôlant le déplacement de pore en pore des molécules piégées.