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La pneumocystose est une infection opportuniste qui affecte principalement les patients immondéprimés. L'introduction de la biologie moléculaire dans le diagnostic de la pneumocystose a amélioré la sensibilité de la détection du pathogène. l'objectif de notre étude est de montrer l'apport de la PCR en temps réel par rapport aux techniques de coloration. Notre étude est rétrospective (janvier 2022-aout 2023), colligeant 6 cas de pneumocystose. Dans 4 cas (67%), des co-infections impliquant Pneumocystis jirovecii ont été détectées en association avec le VIH, le CMV, et le SARS-CoV-2. Une co-infection avec Mycobacterium tuberculosis a été observée dans 1 cas (17%). Les colorations conventionnelles au MGG et au Gomori Grocott modifié par Musto se sont révélées négatives dans tous les cas. Toutefois, l'analyse par PCR en temps réel a montré des résultats positifs pour l'ensemble des échantillons, démontrant une sensibilité de 100%. Les niveaux de charge parasitaire ont varié de 10 à 106 copies/mL. La PCR quantitative est une technique très sensible, avec moins de risque de contamination et constitue une aide le clinicien pour la distinction entre la colonisation et l'infection.