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O carcinoma peniano (CP) é uma doença grave, comum em países em desenvolvimento, que acomete homens com perfil econômico e cultural desfavoráveis. O presente estudo teve como objetivos avaliar a expressão da imunomarcação de COX-2 e VEGF-C no risco de metástase e óbito câncer-específico de pacientes com CP, bem como detectar e genotipar o papilomavírus humano (HPV) tipos 16 e 18 nessa população. Para análise da imumohistoquimica (IHQ) empregou-se o método da imunoperoxidase com anticorpos policlonal e monoclonal, respectivamente, para detecção das proteínas VEGF-C e COX-2. Os achados evidenciam que a expressão de VEGF-C e COX-2 e a detecção de HPV podem auxiliar na identificação de portadores de CP com pior prognóstico. Estes dados devem ser validados em séries com maior número de pacientes e através de estudos com emprego de drogas anti-angiogênicas.