Ce travail a porté sur l analyse de la diversité génétique dans la population marocaine. Plusieurs marqueurs génétiques qui font l objet des études en génétique humaine ont attirés notre attention. En effet, dans un premier temps, et dans le cadre d une analyse à un niveau micro- géographique, nous nous sommes intéressés à l analyse de sept loci correspondant à des phénomènes d insertions Alu. L étude a porté sur six populations de la région du Sud du Maroc, et qui sont Chtouka, Guelmim, Haha, Ouarzazate, Tata et Zagora. Dans un deuxième temps, nous avons choisi d étudier la diversité génétique de la population de Casablanca révélée par l analyse de six microsatellites. L étude de la diversité génétique dans la population marocaine à travers ces marqueurs est particulièrement motivée par un double intérêt : Anthropologique (fondamentale) et Médico-légale (appliqué). Afin d actualiser et de bien préciser la distribution des fréquences phénotypiques et géniques du système ABO et analyser la distribution des allèles du système au Maroc, nous avons mené à la fin de ce travail une analyse sur une série jamais égalée de donneurs de sang de la région du Sud du Maroc (Souss).