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La croissance démographique de Ouagadougou entraîne des problèmes d'alimentation en Eau en quantité et surtout en qualité. Cette étude permet de faire l'état de la ressource en eau souterraine et de sa vulnérabilité. Ouagadougou est bâtie sur des formations de socle cristallin du paléo protérozoïque, recoupées par de grandes fractures orientées Nord-sud et Est-ouest. On a trois niveaux plus ou moins aquifères mais généralement deux nappes et les fractures constituent les voies privilégiées d'arrivée de polluants. Les outils hydrogéochimiques ont permis de comprendre la complexité des aquifères,leur fonctionnement et d'identifier la pollution au niveau des eaux des puits dont la conductivité augmente avec l'alcalinité avec la minéralisation de la matière organique. Une cartographie des nitrates sur 1800 puits met en évidence trois grandes zones avec des teneurs excessives jusqu'à 150 mg/l.La dégradation de la qualité des eaux s'accompagne de la présence de bactéries.La cartographie de la vulnérabilité de la nappe inférieure montre deux zones très vulnérables sur lesquelles une grande attention doit être portée à l'occupation des sols et l'assainissement.