Nos últimos anos, as indústrias farmacêuticas tem despertado um grande interesse por óleos essenciais como agentes antimicrobianos, isso se deve à grande incidência de infecções e a crescente resistência de bactérias e fungos aos antimicrobianos clássicos. Considerando que os óleos essenciais possuem características lipofílicas, sendo insolúveis em água e prontamente rancificados e oxidados, quando expostos à luz. O objetivo deste trabalho foi obter e caracterizar sistemas emulsionados contendo os óleos essenciais de Eucalyptus globulus, Schinus terebinthifolius e Plectranthus amboinicus, avaliar a atividade antifúngica e antibacteriana in vitro e ex vivo, como também, avaliar a toxicidade aguda. As emulsões possibilitam veicular numa mesma formulação substâncias hidrofílicas e lipofílicas permitindo obter um sistema estável e proporcionando uma melhor absorção dos óleos essenciais. Foram avaliadas o estudo de estabilidade, a atividade antifúngica e antibacteriana, como também, oestudo toxicológico agudo. Dessa forma, os resultados sinalizaram perspectivas promissoras para o desenvolvimento de novos agentes fitoterápicos para tratamento das micoses.