Les interactions nappe-rivière sont un sujet de recherche particulièrement complexe en hydrogéologie. Les processus d'échanges entre les eaux de surface et les eaux souterraines sont théoriquement connus mais restent difficilement mesurables. De nombreuses méthodes ont été développées pour analyser ces échanges. Le suivit de l'évolution des signaux des traceurs naturels que sont la température et la conductivité électrique offre des résultats pertinents tout en étant techniquement léger à mettre en place. Cette méthode est testée sur un site connu, les résultats obtenus concordent avec ceux des études précédentes. La rivière Emme dans son haut cours a été identifiée comme infiltrante sur certaines portions et exfiltrante en d'autres. Toutefois ces situations ne sont pas immuables et le sens des échanges peut changer. Le type d'interaction entre la rivière et l'aquifère alluvial présent dans la vallée est donc dynamique spatialement et aussi temporellement. Ceci est particulièrement manifeste aux abords du hameau d'Aeschau.